不久，李成栋整军反扑，把吴之番数百士兵砍杀殆尽，顺带又屠杀了近二万刚刚到嘉定避乱的民众，血流成渠，是为著名的“嘉定三屠”。
清军往往以“恶其反侧”等借口将来降军、民屠戮一空，胆敢反抗的百姓几被杀尽，留下的大抵是一些顺服的奴才。
此外，满清又杀苗民一百万，杀回民数百万，把漠北蒙古的准葛尔部落杀到只留最后一个幼童，在世界历史上都是罕见的残忍。